MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 605 chromosome

Total Repeats: 101098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018078	CGGCC	2	10	182375	182384	0 %	0 %	40 %	60 %	392430567
4002	NC_018078	TGG	2	6	182436	182441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430567
4003	NC_018078	CTG	2	6	182563	182568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
4004	NC_018078	TGG	2	6	182570	182575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430567
4005	NC_018078	CCG	2	6	182631	182636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430567
4006	NC_018078	CCA	2	6	182647	182652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430567
4007	NC_018078	TGA	2	6	182664	182669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430567
4008	NC_018078	TGG	2	6	182694	182699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430567
4009	NC_018078	GCT	2	6	182719	182724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
4010	NC_018078	CCG	2	6	182730	182735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430567
4011	NC_018078	AGC	2	6	182774	182779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430567
4012	NC_018078	TGC	2	6	182801	182806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
4013	NC_018078	GCG	2	6	182852	182857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430567
4014	NC_018078	GCG	2	6	182910	182915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430567
4015	NC_018078	GAT	2	6	183001	183006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392430567
4016	NC_018078	CGG	2	6	183007	183012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430567
4017	NC_018078	CG	3	6	183037	183042	0 %	0 %	50 %	50 %	392430567
4018	NC_018078	GTC	2	6	183049	183054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430567
4019	NC_018078	ACG	2	6	183413	183418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430568
4020	NC_018078	GC	3	6	183454	183459	0 %	0 %	50 %	50 %	392430568
4021	NC_018078	CGCAGA	2	12	183569	183580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4022	NC_018078	GGT	2	6	183594	183599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430569
4023	NC_018078	CGA	2	6	183615	183620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4024	NC_018078	ACG	2	6	183621	183626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4025	NC_018078	GTCGC	2	10	183649	183658	0 %	20 %	40 %	40 %	392430569
4026	NC_018078	GTG	2	6	183668	183673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430569
4027	NC_018078	GC	4	8	183705	183712	0 %	0 %	50 %	50 %	392430569
4028	NC_018078	GCC	2	6	183766	183771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430569
4029	NC_018078	CGT	2	6	183774	183779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4030	NC_018078	CGC	2	6	183791	183796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430569
4031	NC_018078	CGG	3	9	183800	183808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430569
4032	NC_018078	GC	3	6	183881	183886	0 %	0 %	50 %	50 %	392430569
4033	NC_018078	GTC	2	6	183963	183968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4034	NC_018078	TGC	2	6	183998	184003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4035	NC_018078	GAC	2	6	184041	184046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4036	NC_018078	GGC	2	6	184047	184052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430569
4037	NC_018078	GGTGCT	2	12	184074	184085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392430569
4038	NC_018078	CGGCGT	2	12	184086	184097	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	392430569
4039	NC_018078	GGCC	2	8	184098	184105	0 %	0 %	50 %	50 %	392430569
4040	NC_018078	GC	4	8	184136	184143	0 %	0 %	50 %	50 %	392430569
4041	NC_018078	CGA	3	9	184260	184268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4042	NC_018078	GC	3	6	184269	184274	0 %	0 %	50 %	50 %	392430569
4043	NC_018078	CAG	2	6	184276	184281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4044	NC_018078	GAA	2	6	184294	184299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430569
4045	NC_018078	GTG	2	6	184318	184323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430569
4046	NC_018078	CAC	2	6	184326	184331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392430569
4047	NC_018078	GCC	2	6	184346	184351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430569
4048	NC_018078	CCG	2	6	184370	184375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430569
4049	NC_018078	GTG	3	9	184405	184413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430569
4050	NC_018078	GGC	2	6	184432	184437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430569
4051	NC_018078	GTC	2	6	184468	184473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4052	NC_018078	ACG	2	6	184478	184483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4053	NC_018078	TTG	2	6	184573	184578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430569
4054	NC_018078	CGA	3	9	184608	184616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430569
4055	NC_018078	GT	3	6	184632	184637	0 %	50 %	50 %	0 %	392430569
4056	NC_018078	TTG	2	6	184672	184677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392430570
4057	NC_018078	TCG	2	6	184709	184714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430570
4058	NC_018078	GC	3	6	184802	184807	0 %	0 %	50 %	50 %	392430570
4059	NC_018078	TGG	2	6	184808	184813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430570
4060	NC_018078	TCG	2	6	184862	184867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430570
4061	NC_018078	GGT	2	6	184869	184874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430570
4062	NC_018078	CGG	2	6	184896	184901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430570
4063	NC_018078	ACCG	2	8	184912	184919	25 %	0 %	25 %	50 %	392430570
4064	NC_018078	AAG	2	6	184942	184947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392430570
4065	NC_018078	GCCA	2	8	184956	184963	25 %	0 %	25 %	50 %	392430570
4066	NC_018078	CGA	2	6	184974	184979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430570
4067	NC_018078	CAT	2	6	185021	185026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
4068	NC_018078	CGC	2	6	185099	185104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430571
4069	NC_018078	GGC	2	6	185126	185131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430571
4070	NC_018078	AC	3	6	185150	185155	50 %	0 %	0 %	50 %	392430571
4071	NC_018078	ATC	2	6	185172	185177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
4072	NC_018078	TGG	3	9	185185	185193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430571
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4075	NC_018078	TTC	2	6	185259	185264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392430571
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4080	NC_018078	ATC	2	6	185394	185399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
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4082	NC_018078	ATC	2	6	185451	185456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430571
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4102	NC_018078	GCA	2	6	185984	185989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4103	NC_018078	GGA	2	6	186017	186022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392430571
4104	NC_018078	GCCG	2	8	186060	186067	0 %	0 %	50 %	50 %	392430571
4105	NC_018078	TGC	2	6	186088	186093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4106	NC_018078	GGCCGA	2	12	186095	186106	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392430571
4107	NC_018078	ACG	2	6	186115	186120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4108	NC_018078	GAC	2	6	186135	186140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4109	NC_018078	ACG	2	6	186145	186150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430571
4110	NC_018078	ACG	2	6	186190	186195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430571
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4482	NC_018078	TGC	2	6	203281	203286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430587
4483	NC_018078	GGC	2	6	203339	203344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392430587
4484	NC_018078	AC	3	6	203370	203375	50 %	0 %	0 %	50 %	392430587
4485	NC_018078	GTG	2	6	203382	203387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430587
4486	NC_018078	ACT	2	6	203530	203535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392430587
4487	NC_018078	GCC	2	6	203612	203617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392430587
4488	NC_018078	GTG	2	6	203700	203705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392430587
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4490	NC_018078	CGT	2	6	203806	203811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392430587
4491	NC_018078	CCCG	2	8	203825	203832	0 %	0 %	25 %	75 %	392430587
4492	NC_018078	ACG	2	6	203848	203853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392430587
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4500	NC_018078	GATC	2	8	204234	204241	25 %	25 %	25 %	25 %	392430588

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